Scientific and Research Projects
SFB 1425
Projekt S03 Zentrale Unterstützung für FACS-Sortierung, Sequenzierung und bioinformatische Analyse
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.07.2020 until 30.06.2024
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Bioinformatics DATa ENvironment (BioDATEN)
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.07.2019 until 30.06.2023
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BMBF Verbundprojekt CompLS: RNAProNet - Integration des Netzwerks aus RNA- und Proteinbasierter Regulation
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.04.2019 until 31.03.2022
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EU-Projekt EOSC-Life
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Project Manager: Dr. Bjorn Grüning
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Start/End of project: 01.03.2019 until 28.02.2023
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Funktionelle Charakterisierung der nicht-kodierenden RNA Pantr1 in der FOXG1-abhängigen Vorderhirnentwicklung und im Rett-Syndrom
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2019 until 2023
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DFG Projekt: Z-Projekt CRISPR Bioinformatik
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2019 until 2022
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Centre for Integrative Biological Signalling Studies – CIBSS
Projekt D1 Determination of transcriptional and post-transcriptiponal regulatory modules from sets of single-cell RNA-seq data
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Project Manager: Prof.Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.01.2019 until 30.06.2022
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DFG Projekt: Zentrales Projekt Z2: Ribosomenprofiling und Bioinformatik
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.08.2018 until 31.07.2021
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DFG Graduiertenkolleg „MeInBio – BioInMe: Exploration of spatio-temporal dynamics of gene regulation using high-throughput and high-resolution methods
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.09.2017 until 28.02.2022
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DFG-Projekt: Vorhersage von RNA-RNA Interaktionen durch kinetische Modellierung
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Project Manager: Backofen R
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Start/End of project: 01.01.2017 until 28.02.2021
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SFB/Transregio 167 „Entwicklung, Funktion und Potential von myeloiden Zellen im zentralen Nervensystem (NeuroMac)“
Teilprojekt Z01 „Genomics and bioinformatics core“
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Project Manager: Backofen R
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Start/End of project: 2017 until 2020
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DFG-Projekt: Die Populationsgenetik des CRISPR-Cas-Systems in Bakterien
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.01.2017 until 30.04.2020
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BMBF Verbundprojekt Deutsches Netzwerk für Bioinformatik-Infrastruktur de.NBI – Partner – de.NBI-epi
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.11.2016 until 31.12.2021
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DFG Projekt eCLASH: Definition des Interactomes kleiner RNA
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.01.2016 until 30.04.2021
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Centre for Biological Signalling Studies
SELEX for synthetic biology and nanoscale applications
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.11.2015 until 31.12.2018
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BWST_NCRNA_008
Determinanten der Interaktion nicht-kodierender RNAs mit regulatorischen Zielmolekülen
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.09.2015 until 31.10.2018
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DFG-Projekt:Extending the theory of Algebraic Dynamic Programming for applications in bioinformatics
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.08.2015 until 31.07.2018
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BMBF Verbundprojekt Deutsches Netzwerk für Bioinformatik-Infrastruktur (de.NBI)
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.03.2015 until 31.12.2021
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DFG-Projekt: Ein flexibles und effizientes System für RNA Sequenz-Struktur-Motive
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2015 until 2020
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DFG-Projekt: Isolierung und funktionelle Charakterisierung von nicht-kodierenden RNAs in der FOXG1-abhängigen Vorderhirnentwicklung und im Rett-Syndrom
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.01.2015 until 31.10.2020
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DFG Forschergruppe Untersuchung der prokaryotischen Immunsysteme I-B und I-D in archaea
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.01.2015 until 31.08.2019
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DFG-Projekt: ATP – Automatisierte intra-annuelle Jahrringanalyse für Dendroökologische Forschung
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.01.2015 until 31.05.2019
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DFG-Projekt: MiRNA and RNA-binding proteins as integral part of cell communication: context-based target prediction and validation
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2015 until 2017
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BMBF-Verbundprojekt e:Bio
ReelinSys – Systembiologie Reelin-assoziierter neuropsychiatrischer Erkrankungen
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2013 until 2015
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BMBF-Verbundprojekt e:Bio
RNAsys – Systembiologie der RNA
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2013 until 2015
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SFB 992 Medizinische Epigenetik
Projekt Z01 - Tiefensequenzierung/Bioinformatik
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.07.2012 until 30.06.2024
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Ideenwettbewerb Biotechnologie und Medizintechnik
Ein synthetischer Schaltmechanismus zur Kontrolle der Funktion und Lokalisation von
Proteinen in tierischen und menschlichen Zellen
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2012 until 2015
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DFG Forschergruppe
Unravelling the prokaryotic immune system
Bioinformatic analyses of CRISPR elements
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2012 until 2014
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DFG-Projekt: MicroRNA as an integral part of cell communication: regularized target prediction and network preditction
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2012 until 2014
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DFG-Projekt: Computational Detection of Bacterial ncRNAs and their Targets
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.06.2010 until 31.05.2013
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DFG-Projekt: MicroRNA as an integral part of cell communication: regularized target prediction and network prediction
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2010 until 2011
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Project Details
DFG-Projekt: A Flexible and Efficient System for the Detection of RNA Sequence/Structure Motifs
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2009 until 2012
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Centre for Biological Signalling Studies bioss from Analysis to Synthesis
Area D1 Pathway assembler
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2008 until 2011
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DFG-Projekt: Computational Detection of Bacterial ncRNAs and their Targets
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.05.2007 until 31.05.2010
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Freiburg Initiative for Systems Biology – FRISYS
WP2 miRNAs and WP3 Transcriptional networks
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.10.2006 until 31.12.2009
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DFG SFB 604 INST 275/169-1
Alternative Splicing as a Modulator of Signal Transdruction
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 06.06.2005 until 01.08.2009
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EU-Projekt: Emergent organisation in complex biomolecular systems, EMBIO - Specific Targeted Research Project,
NEST – EC Contract No. 012835
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.03.2005 until 31.08.2008
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EU-Projekt: Reasoning on the Web with Rules and Semantics –REWERSE,
Network of Excellence – EC Contract No. 506779
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.04.2004 until 29.02.2008
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Project Details
Verbundprojekt JCB (FSU) Jenaer Centrum für Bioinformatik FSU/Kern,
Projekt D.5 (Stochastische, constraint-basierte Ansätze zur Beschreibung von regulativen Sequenzen, Forschungsvorhaben 0312704K
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 01.02.2003 until 31.12.2007
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Project Details
DFG-Projekt: Schwerpunktprogramm Selenproteine – Biochemische Grundlagen und klinische Bedeutung – SPP 1087
Projekt: Algorithmic determination of whether a protein’s cysteine residue can be replaced by selenocysteine by silent/similar pointwise mutagenesis in DANN/RNA
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Project Manager: Prof. Dr. Rolf Backofen
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Start/End of project: 2002 until 2005
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Project Details
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