BMBF-Verbundprojekt e:Bio ReelinSys – Systembiologie Reelin-assoziierter neuropsychiatrischer Erkrankungen

Description of the project:
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Das Verbundprojekt ReelinSys ist ein interdisziplinäres Konsortium, in dem die Expertisen renommierter Systembiologen, neurobiologischer Grundlagenwissenschaftler, psychiatrischer Kliniker, Mikrosystemtechniker und Bioinformatiker gebündelt werden, um systembiologische Methoden auf ein aktuelles, kompetitives Forschungsthema auf dem Gebiet der Neuropsychiatrie anzuwenden. Mit diesem Ansatz wird das Ziel verfolgt, exemplarisch ein Rahmenkonzept aufzustellen, bei dem ein umfassendes molekulares und systembiologisches Verständnis des komplexen Reelin-Signalnetzwerks in eine zukünftige klinisch-diagnostische und pharmakologisch-therapeutische Anwendung auf neuropsychiatrische Krankheitsbilder translatiert wird. Für die erfolgreiche Rekonstruktion von regulatorischen Netzwerken hat sich herausgestellt, dass die Information aus Expressions-Daten mit Informationen über andere regulatorische Komponenten wie Protein-Protein oder Protein-RNA-Interaktionen kombiniert werden müssen. Dies ist insbesondere auch deshalb wichtig, um die Information aus Projektteil I (zelluläres Modell) mit integrieren zu können. Bezüglich Protein-Protein Interaktionen ist zu sagen, dass einer der Hauptkomponenten in der Reelin-Signalkaskade das Dab1-Protein ist, welches downstream Signalmoleküle über SH2/PTB Interaktionen rekrutiert. Eine weitere Schlüsselfigur ist Nova2, welches Reelin-Signalling durch alternatives Spleißen von Dab1 moduliert. Hierbei moduliert Nova2 das alternative Splicen durch eine Protein-RNA Interaktion, ist also ein Spleißfaktor.

Additional information: http://www.bioinf.uni-freiburg.de
contact person: Prof. Dr. Rolf Backofen
Phone: 0761 203 7461
Email: backofen@informatik.uni-freiburg.de
Runtime:
Start of project: 2013
End of project: 2015
Project Management:
Albert-Ludwigs-University Freiburg
Prof. Dr. Rolf Backofen
Bioinformatik
Prof. Dr. Rolf Backofen
Georges-Köhler-Allee 106
79110 Freiburg
Germany

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Fax: +49 (0) 761-203-7462
Email: backofen@informatik.uni-freiburg.de
http://www.bioinf.uni-freiburg.de
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