[Zurück]
 
Bitte auswählen
Jahr
Details
Sprache
Sortierung
Ausgabe
neu: RTF !
 Forschungsbericht für das Jahr 2017

Institut für Biologie III

Genetik und Experimentelle Bioinformatik

Schänzlestr. 1
79104 Freiburg
Tel: ++49-761-203-2796 Fax: ++49-761-203-2745
Email karin.laubenberger@biologie.uni-freiburg.de
http://www.cyanolab.de/


Wissenschaftliche Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter

  • Prof. Dr. Wolfgang R. Hess, Leitung (m/w)
  • Dr. Jens Georg, Postdoc (m/w), Akademische Rat
  • Dr. Stephan Klähn, Postdoc (m/w)
  • Dr. Thomas Wallner
  • Dipl.-Biol. Viktoria Reimann
  • Ingeborg Scholz
  • Katharina Kienzler
Einträge in der Rubrik "Who is Who"

Finanzierung

  • BMBF de.NBI Partnerprojekt "Structured Analysis and Integration of RNA-Seq experiments (de.STAIR)"
  • DFG / FOR1680 - Forschergruppe - Analyse des prokaryotischen Immunsystems
  • DFG Einzelantrag / "Der Einfluss von DNA-Methylierungen auf die Genexpression bei Cyanobakterien"
  • Programm „Nicht-kodierende RNAs“ der Baden-Württemberg Stiftung: "Determinanten der Interaktion nicht-kodierender RNAs mit regulatorischen Zielmolekülen"
  • DFG / "Funktionen kleiner Proteine, Peptide und von Transkripten dualer Funktion in Cyanobakterien"
  • DFG GRK 2344/1 "MeInBio - BioInMe: Untersuchung räumlicher und zeitlicher Dynamik der Genregulation mit hochauflösenden Hochdurchsatzverfahren"
  • German-Israeli Foundation for Scientific Research and Development: "Deciphering the role of OxyS toxicity in bacterial response to oxidative stress"
  • Joint research between FRIAS and the Strasbourg Institute for Advanced Studies (USIAS), "MapRNA: Mapping RNA-RNA pairings in vivo in bacteria and their importance in fast acclimation processes"
  • Grünewald-Zuberbier-Stiftung
  • Forschungsprogramm Bioökonomie BWB „Mikroalgen: CYANOFOOD - Strategien zur Maximierung des Potenzials von Mikroalgen für die Produktion von essenziellen Aminosäuren in Photobioreaktoren“

Wissenschaftliche Projekte und Forschungsvorhaben


  • "MapRNA: Kartierung von RNA-RNA Interaktionen in Bakterien und ihre Bedeutung in schnellen Akklimatisierungsprozessen in vivo"
  • Analyse des prokaryotischen Immunsystems - Subprojekt "Cyanobakterielle CRISPR-Cas Systeme - ein bakteriell-archaeales Hybrid ?"
  • CYANOFOOD
  • Deciphering the role of OxyS toxicity in bacterial response to oxidative stress
  • Der Einfluss von DNA-Methylierungen auf die Genexpression bei Cyanobakterien
  • Grünewald-Zuberbier-Stiftung
  • Identifikation von Interaktionspartnern zweier potentiell regulatorischer Proteine in photosynthetischen Mikroorganismen
  • Partner-Projekt des Deutschen Netzwerks für Bioinformatik-Infrastruktur – de.NBI: "Structured Analysis and Integration of RNA-Seq experiments (de.STAIR)"

Wissenschaftliche Publikationen

Originalarbeiten in wissenschaftlichen Fachzeitschriften:
  • Georg J, Kostova G, Vuorijoki L, Schon V, Kadowaki T, Huokko T, Baumgartner D, Muller M, Klahn S, Allahverdiyeva Y, Hihara Y, Futschik ME, Aro EM, Hess WR: Acclimation of Oxygenic Photosynthesis to Iron Starvation Is Controlled by the sRNA IsaR1. Curr Biol, 2017. : http://dx.doi.org/10.1016/j.cub.2017.04.010
  • Miller DR, Pfreundt U, Elifantz H, Hess WR, Berman-Frank I: Microbial metatranscriptomes from the thermally stratified Gulf of Aqaba/Eilat during summer. Mar Genom, 2017; 32: 23-26. : http://dx.doi.org/10.1016/j.margen.2016.12.001
  • Pfreundt U, Spungin D, Hou S, Voss B, Berman-Frank I, Hess WR: Genome of a giant bacteriophage from a decaying Trichodesmium bloom. Mar Genom, 2017. : http://dx.doi.org/10.1016/j.margen.2017.02.001
  • Reimann V, Alkhnbashi OS, Saunders SJ, Scholz I, Hein S, Backofen R, Hess WR: Structural constraints and enzymatic promiscuity in the Cas6-dependent generation of crRNAs. Nucleic Acids Res, 2017; 45 (2): 915-925. : http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkw786
  • Srikumar A, Krishna PS, Sivaramakrishna D, Kopfmann S, Hess WR, Swamy MJ, Lin-Chao S, Prakash JS: The Ssl2245-Sll1130 Toxin-Antitoxin System Mediates Heat-induced Programmed Cell Death in Synechocystis sp. PCC6803. J Biol Chem, 2017; 292 (10): 4222-4234. : http://dx.doi.org/10.1074/jbc.M116.748178
  • Zhu T, Hou S, Lu X, Hess WR: Draft Genome Sequences of Nine Cyanobacterial Strains from Diverse Habitats. Genome Announc, 2017; 5 (9). : http://dx.doi.org/10.1128/genomeA.01676-16

Besondere wissenschaftliche Aktivitäten

Ehrung:
  • Prof. Wolfgang Hess: William Evans Fellow (Gastprofessur) University of Otago, New Zealand, seit 01.02.2012.
  • Prof. Wolfgang R. Hess: Fellow at the Freiburg Institute of Advanced Studies (FRIAS), Selected for joint projects by FRIAS and the Strasbourg Institute for Advanced Studies (USIAS) with the project "MapRNA: Mapping RNA-RNA pairings in vivo in bacteria and their importance in fast acclimation processes", 01.10.2017 bis 30.09.2019.
Fakultaet:
  • Prof. Wolfgang R. Hess: Geschäftsführender Direktor des Instituts für Biologie 3, seit 01.10.2010.
  • Prof. Wolfgang R. Hess: Direktor des Prüfungsausschuss Bachelor of Science & Master of Science & Diplom, seit 01.10.2011.

Abschlussarbeiten

Promotionen
  • Gergana Kostova: Regulation by the sRNA IsaR1 and transcriptome remodelling under iron starvation in Synechocystis sp. PCC 6803, 2017.




Gastwissenschaftler:

  • Manuel Brenes-Álvarez, Universidad de Sevilla, Spanien, Sevilla, 27.04.2017 bis 31.07.2017
  • Dr. Taro Kadowaki, University of Saitama, Japan, Saitama, 2017
  • Dr. Xiaoming Tan, Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology (QIBEBT) Chinese Academy of Sciences, China, Qingdao, 25.05.2017 bis 20.11.2017