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Forschungsbericht]

Einzelzell-Drucker für die genomische und massenspektrometrische Analyse einzelner Bakterien (SiBaGeM)

Projektbeschreibung:
Die Kultivierung zum Nachweis von Pathogenen verhindert in vielen Fällen eine schnelle und präzise Diagnose von Infektionskrankheiten. Zudem gilt der Großteil aller bakteriellen Spezies als nicht kultivierbar im Labor. Die Molekularanalyse auf Einzelzellebene erlaubt es Bakterien ohne zusätzlichen Kultivierungsschritt zu identifizieren und deren Genom zu analysieren. Sie birgt daher ein großes Potential, nicht nur für das Entdecken neuer Spezies und Gene, sondern auch für eine deutlich schnellere Diagnostik im klinischen Alltag. In SiBaGeM werden neue Dispensierchips und Assays für den am IMTEK entwickelten Einzelzelldrucker entwickelt, wodurch eine automatisierte Analyse einzelner Bakterienzellen auf Genom- und Transkriptomebene ermöglicht werden soll. Des Weiteren soll durch die gezielte experimentelle Untersuchung der für die Technologie maßgeblichen Tropfenentstehung neue Erkenntnisse geschaffen werden, für (i) die elektrostatische Neutralisation der Tropfen, (ii) die Tropfensortierung mit höherem Durchsatz, und (iii) die kontrollierte Kristallisierung einer MALDI Matrix für die nachfolgende Analyse einzelner Bakterien mit einem neuartigem Massenspektrometer. Das Ziel des europäischen Verbundprojektes SiBaGeM ist es ein Laborgerät für die Einzelzell-Genomik und ein Einzelzell-Massenspektrometer für eine schnellere Diagnostik von Infektionskrankheiten zu entwickeln.

Ansprechpartner: Julian Riba
Tel: 0761 203-73216
Email: julian.riba@intek.uni-freiburg.de
Projektlaufzeit:
Projektbeginn: 01.06.2016
Projektende: 30.11.2018
Projektleitung:
Julian Riba (Prof. Dr. Roland Zengerle)

Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Anwendungsentwicklung
Prof. Dr. Roland Zengerle
Georges-Koehler-Allee 103
79110 Freiburg

Telefon: +49 761 203 73211
Fax: +49 761 203 73299
http://www.imtek.de/anwendungen/
Kooperationspartner
Cytena GmbH, Freiburg Biosparq B.V., Amsterdam Medical Center
Finanzierung:

  • BMBF - Eurostars Programm

Schlagworte:

    InkJet & Drucktechnologien, Analytik & Diagnostik, Mikrodosierung, Einzelzellanalyse, Genomanalyse, Sequenzierung, Massenspektroskopie, Medizinische Mikrobiologie, inkjet & printing technologies, analytics & diagnostics, microdosing, single-cell analysis, single-cell genomics, sequencing, mass spectrometry, medical microbiology

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