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neu: RTF !
 Forschungsbericht für das Jahr 2018

Physikalisches Institut

Biomolekulare Dynamik

Prof. Dr. Gerhard Stock

Hermann-Herder-Str. 3
79104 Freiburg
Tel: 0761-203 5750 Fax: 0761-203 5883
Email group.stock [at] physik.uni-freiburg.de
http://www.moldyn.uni-freiburg.de/


Wissenschaftliche Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter

Einträge in der Rubrik "Who is Who"

Forschungsschwerpunkte

  • Biomolecular Energy and Signal Transport
  • Free Energy Landscapes of Biomolecules
  • Vibrational Signatures of Biomolecular Dynamics
  • Functional Dynamics of RNA
  • Ultrafast Nonadiabatic Photoreactions
  • Maximum Caliber

Finanzierung

  • DFG - STO 247/11-1

Wissenschaftliche Publikationen

Originalarbeiten in wissenschaftlichen Fachzeitschriften:
Konferenzbeiträge:
  • Gulzar A, Valino-Borau L, Wolf S, Stock G: Energy Transport in Biomolecules, 2018 (DPG-Frühjahrstagung, Berlin). : http://berlin18.dpg-tagungen.de/
  • Lickert B: Long Time Dynamics from Short MD Simulations: a comparison of Markov State and Langevin Moleling, 2018 (Computer Simulation and Theory of Macromolecules, Kloster Huenfeld).
  • Post M: Principal component analysis for non-equilibrium simulations, 2018 (Computer Simulation and Theory of Macromolecules, Kloster Huenfeld).
  • Stock G: Time-resolved observation of protein allosteric communication, 2018 (Protein Dynamics TSRC Conference at Les Houches, France).
  • Valino-Borau L, Gulzar A, Buchenberg S, Stock G: Scaling rules for vibrational energy transport in proteins, 2018 (DPG-Frühjahrstagung, Berlin). : http://berlin18.dpg-tagungen.de/
  • Wolf S, Stock G: Langevin modeling of targeted molecular dynamics: a novel approach to calculate equilibrium free energies from non-equilibrium simulations, 2018 (DPG-Frühjahrstagung, BP12, Berlin). : http://berlin18.dpg-tagungen.de/

Besondere wissenschaftliche Aktivitäten

Abschlussarbeiten

Promotionen
  • Ernst M: Finding Reaction Coordinates for Protein Folding and Functional Motion (Betreuer/in Prof. Dr. Gerhard Stock, Erstgutachter/in Prof. Dr. Gerhard Stock), 2018.
  • Sittel F: The Secret Life of Proteins: Exploring Molecular Dynamics through Statistics (Betreuer/in Prof. Dr. Gerhard Stock, Erstgutachter/in Prof. Dr. Gerhard Stock), 2018. https://doi.org/10.6094/UNIFR/15775
Bachelor
  • Ohnemus A: Photoswitchable PDZ2 Domain (Betreuer/in Prof. Dr. Gerhard Stock, Erstgutachter/in Prof. Dr. Gerhard Stock), 2018.
  • Schäffler M: Targeted Molecular Dynamics Simulations of the Unbinding of a S-Peptide from RNase, (Betreuer/in Prof. Dr. Gerhard Stock, Erstgutachter/in Prof. Dr. Gerhard Stock), 2018.
  • Weber A: Comparison of Network Models for the Analysis of Protein Dynamics (Betreuer/in Prof. Dr. Gerhard Stock, Erstgutachter/in Prof. Dr. Gerhard Stock), 2018.