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 Research Report for 2015

Abteilung für Mathematische Stochastik

Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber

Ernst-Zermelo-Straße 1
79104 Freiburg
Tel: 0761/203-5664 Fax: 0761/203-5661
Email sekretariat@stochastik.uni-freiburg.de
http://www.stochastik.uni-freiburg.de/pfaffelhuber


Scientific Employees

  • Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber, Leitung (m/w)
  • PD Dr. Dr. Heinz Weisshaupt, Postdoc (m/w)
  • Dr. Franz Baumdicker, Postdoc (m/w)
  • Dr. Andrej Depperschmidt, Postdoc (m/w)
  • Sebastian Bossert, Doktorand (m/w)
  • Peter Czuppon, Doktorand (m/w)
  • Maximilian Gerhards, Doktorand (m/w)
  • Felix Hermann, Doktorand (m/w)
Entries in "Who is Who"

Main Research

  • Stochastik, Biomathematik
  • Probabilistic modeling in the life sciences
  • Population genetics
  • Chemical reaction networks
  • Markov processes

Scientific and Research Projects


  • Bacterial population genomics.
    • Project Manager: Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber
    • Start/End of project: 01.05.2008 until 31.12.2015
    • Project Details
  • Der Effekt natürlicher Selektion auf Genealogien
    • Project Manager: Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber
    • Start/End of project: since 2015
    • Project Details
  • Konvergenz von Markov-Prozessen unter mehreren Zeitskalen
    • Project Manager: Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber
    • Start/End of project: since 2015
    • Project Details
  • Quorum sensing in bacteria
    • Project Manager: Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber
    • Start/End of project: 01.04.2008 until 31.12.2015
    • Project Details
  • The signature of strong positive selection in natural populations.
    • Project Manager: Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber
    • Start/End of project: since 2006
    • Project Details
  • Tree-valued stochastic processes
    • Project Manager: Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber
    • Start/End of project: since 2005
    • Project Details

Scientific publications

Journal Articles:
  • Baumdicker F: The site frequency spectrum of dispensable genes. Theor Popul Biol, 2015; 100: 13-25.
  • Depperschmidt A, Pardoux E, Pfaffelhuber P: A mixing tree-valued process arising under neutral evolution with recombination. Electron J Probab, 2015; 20 (94) (online): 1-22.
  • Depperschmidt A, Pfaffelhuber P, Scheuringer A: Some large deviation results for Kingman's coalescent. Electron Commun Prob, 2015; 20 (7) (online): 1-14. : http://dx.doi.org/10.1214/ECP.v20-3107
  • Jansen M, Pfaffelhuber P: Stochastic gene expression with delay. J Theor Biol, 2015; 364: 355-363. : https://doi.org/10.1016/j.jtbi.2014.09.031
  • Mélykúti B, Pfaffelhuber P: The stationary distribution of a Markov jump process on a state space glued together from two state spaces at two vertices. Stoch Models, 2015; 31 (4): 525-553. : https://doi.org/10.1080/15326349.2015.1055769
  • Pfaffelhuber P, Popovic L: Scaling limits of spatial chemical reaction networks. Ann Appl Probab, 2015; 25 (6): 3162-3208. : http://dx.doi.org/10.1214/14-AAP1070
  • Pfaffelhuber P, Popovic L: How spatial heterogeneity shapes multiscale biochemical reaction network dynamics. J R Soc Interface, 2015; 12 (104): 1-8. : http://dx.doi.org/10.1098/rsif.2014.1106
  • Schlüter J, Czuppon P, Schauer O, Pfaffelhuber P, McIntosh M, Becker A: Classification of phenotypic subpopulations in isogenic bacterial cultures by triple promoter probing at single cell level. J Biotechnol, 2015; 198: 3-14. : https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2015.01.021

Special Scientific Activities

Scientific Dissertations

Dissertations
  • Jansen M: Die Modellierung der Genexpression und des humanen Lipoproteinmetabolismus, 2015.
Degree Dissertations
  • Stiefvater S: Dualität bei Markov-Prozessen, 2015.
  • Striemann D: Stochastische Modelle der Genexpression, 2015.
Master
  • Enya Weber: Variance of Brier scores under random sampling of prognostic subgroups (Advisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber, Supervisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber), 2015.
  • Felix Beck: Parameter Estimation in a percolation Model with Coloring (Advisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber, Supervisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber), 2015.
  • Florian Fischer: Die Doob-Martin Kompaktifizierung in der Algorithmenanalyse (Advisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber, Supervisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber), 2015.
  • Gerlach K: Statistische Studie zum Feedback bei privatem Energieverbrauch, 2015.
  • Susanne Steinhauser: Determining optimal cut-offs in the meta-analysis of diagnostic test accuracy studies (Advisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber, Supervisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber), 2015.
Bachelor
  • Annika Walter: Klinman's Malkästen und austauschbare Partitionen (Advisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber, Supervisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber), 2015.
  • Luisa Schulz: Erweiterung des Sekretärinnenproblems (Advisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber, Supervisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber), 2015.
  • Mathis Ruf: Eine Erweiterung der Polya-Urne (Advisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber, Supervisor Prof. Dr. Peter Pfaffelhuber), 2015.
  • Ruf H: Ein Duplikations-Deletions-Modell eines zufälligen Graphen, 2015.
  • Ulmer F: Der Bootstrap, 2015.
State Examinations
  • Isak R: Extremwerttheorie: Konvergenzverhalten von Verteilungen, 2015.
  • Korn F: Vergleich stochatischer und deterministischer Gleichgewichte chemischer Prozesse, 2015.